أفادت وزارة حماية البيئة الإسرائيلية أن استمرار تصريف المجاري غير المعالجة أو المعالجة جزئياً في الأنهار والجداول يعتبر المصدر الأول للتلوث الخطير في إسرائيل. ونقلت شبكة الأنباء الإنسانية (إيرين) عن مسؤولي الوزارة أنه على الرغم من أن البلديات هي المسؤولة عن معالجة مياه الصرف الصحي. كما تعرض نهر اليركون في المنطقة الوسطى للتلوث، في حين تلوث نهر كيشون بالقرب من مدينة حيفا، كما لم يسلم نهر الأردن من آفة التلوث، حيث قال هيليل كلاسمان من سلطة المنتزهات والمحميات الطبيعية إنه يتم تصريف مياه الصرف الصحي التي لم تخضع سوى لمعالجة أساسية في المنطقة الجنوبية لنهر الأردن مما يحوله إلى أنبوب للمجاري.
